Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fbxw18Q3TSA9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fbxw18Q3TSA9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms