Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc10Q3TLI0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc10Q3TLI0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms