Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Prrc2cQ3TLH4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Prrc2cQ3TLH4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms