Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cwc27Q3TKY6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cwc27Q3TKY6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms