Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Smarca4Q3TKT4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Smarca4Q3TKT4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms