Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf2f1Q3THK3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2f1Q3THK3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms