Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm1Q2TV84 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpm1Q2TV84 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms