Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vax1Q2NKI2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms