Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd11Q1RNF8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd11Q1RNF8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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