Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sap25Q1EHW4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Sap25Q1EHW4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sap25Q1EHW4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms