Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptcd3Q14C51 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms