Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3ip1Q149C2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Traf3ip1Q149C2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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