Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp2b3Q0VF55 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp2b3Q0VF55 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms