Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tigd2Q0VBL1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tigd2Q0VBL1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms