Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms