Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc3h18Q0P678 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc3h18Q0P678 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms