Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Neurl1bQ0MW30 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms