Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TrioQ0KL02 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TrioQ0KL02 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms