Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn2bQ0KL01 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms