Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Znf541Q0GGX2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Znf541Q0GGX2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms