Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms