Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LyarQ08288 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LyarQ08288 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1338.7 ms