Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms