Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MestQ07646 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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MestQ07646 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MestQ07646 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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MestQ07646 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MestQ07646 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MestQ07646 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MestQ07646 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MestQ07646 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MestQ07646 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MestQ07646 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MestQ07646 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MestQ07646 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MestQ07646 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MestQ07646 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MestQ07646 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MestQ07646 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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