Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Col17a1Q07563 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col17a1Q07563 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms