Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdx4Q07424 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms