Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cntn3Q07409 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cntn3Q07409 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms