Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdf3Q07104 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdf3Q07104 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms