Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Siah2Q06986 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms