Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Siah1bQ06985 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms