Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPINDOCQ05AH6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms