Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs3Q05895 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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