Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdk18Q04899 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms