Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sox12Q04890 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox12Q04890 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms