Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Emx2Q04744 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms