Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RelaQ04207 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms