Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcnd1Q03719 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcnd1Q03719 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms