Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff2Q03404 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms