Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms