Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb4Q02738 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms