Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GscQ02591 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GscQ02591 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GscQ02591 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GscQ02591 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms