Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdcd1Q02242 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms