Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms