Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ascl1Q02067 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms