Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mc1rQ01727 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms