Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gbp1Q01514 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms