Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
EgfrQ01279 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms