Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HmgcrQ01237 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms