Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2bQ01097 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms