Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PrcdQ00LT2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms